El ISNI (ISO 27729) es el número internacional normalizado destinado a identificar a los autores de obras de creación al igual que a los que participan en su difusión. El Centro Internacional del ISSN es miembro de la Agencia Internacional del ISNI y utiliza los números ISNI existentes para completar las entradas del Registro ISSN, en particular para identificar editoriales colectivamente. Esta práctica se difunde asimismo en los Centros Nacionales del ISSN para promover la interoperabilidad entre ISSN e ISNI.

En diciembre de 2015, el Centro Internacional del ISSN y DOAJ firmaron un memorando de acuerdo cuyo objetivo es asegurar la promoción recíproca de las dos partes y favorecer el intercambio de los metadatos correspondientes a las publicaciones seriadas de acceso público, en el marco del servicio ROAD. La ventaja de este acuerdo de trabajo es que suministra una visión general de los periódicos y revistas de acceso público con una evaluación fiable. Estar indexado en el DOAJ significa que cada publicación cumple con los imperativos de calidad requeridos.

GS1 es una organización internacional que define, entre otras cosas, las especificaciones de los códigos de barras. El acuerdo firmado entre GS1 y el Centro Internacional del ISSN permite utilizar los números ISSN en el código de barras, conforme a las especificaciones EAN13, con el prefijo 977 reservado a las publicaciones seriadas.

La International Federation of Library Associations and Institutions (IFLA) es el principal organismo internacional que representa los intereses de las bibliotecas y servicios de información y sus usuarios. Es la voz global de la biblioteca y los profesionales de la información.

El Centro Internacional del ISSN es miembro de IFLA y participa en muchos de los comités de IFLA.

La Directora del Centro Internacional del ISSN es la secretaria del Comité Permanente de publicaciones en serie de IFLA y Otros Recursos Continuos, y la Jefa de Proyectos del Centro Internacional del ISSN es el presidente del Grupo de Revisión PRESSoo de IFLA. El personal del ISSN es miembro de enlace en la Sección de Catalogación y en dos subgrupos del Comité de Normas: el Grupo de Revisión del Modelo Conceptual Bibliográfico y el Grupo de Revisión de la norma ISBD. Actualmente están participando en el grupo de trabajo para la revisión del Manual de Procedimiento de Normas de IFLA, y en el ISBD para el Grupo Especial de Manifestación.

La Oficina de Publicaciones de la Unión Europea es el proveedor oficial de servicios de edición para el conjunto de instituciones, órganos y agencias de la Unión Europea. Esta oficina apoya desde hace varios años al Centro Internacional del ISSN contribuyendo financieramente a su presupuesto. La Oficina de Publicaciones de la Unión Europea asigna los ISSN y gestiona los registros de las instituciones europeas.

Latin de Latindex constituye una importante iniciativa impulsada en 1997 por la Universidad Nacional Autónoma de México (UNAM) con el fin de promover la visibilidad y la difusión de revistas científicas iberoamericanas y mejorar la calidad de las revistas publicadas en esta zona geográfica. En septiembre de 2015, Latindex y el Centro Internacional del ISSN firmaron un acuerdo por un plazo de tres años, cuyo objetivo es promover el fortalecimiento de ambos organismos e intercambiar metadatos sobre las publicaciones periódicas.

Fundado en 1939, La Organización Nacional de Normas de Información (NISO, del inglés National Information Standards Organization) es una asociación no gubernamental, sin fines de lucro y basada en la industria. NISO está acreditado por el Instituto Nacional Americano de Normas (ANSI, del inglés American National Standards Institute) para identificar, desarrollar, mantener y publicar voluntariamente normas basadas en el consenso para la gestión de la información.
El Centro Internacional del ISSN es un miembro con derecho a voto de la NISO: https://www.niso.org/members/issn-international-centre
El Centro Internacional del ISSN apoya el objetivo de NISO de fomentar el desarrollo y mantenimiento de estándares que faciliten la creación, la gestión persistente y el intercambio efectivo de información para que se pueda confiar en su uso en investigación y aprendizaje.