GS1国际组织的工作包括制订条码相关要求。GS1与ISSN国际中心签署协议，确保在条码中使用ISSN号时遵守EAN13（欧洲商品编码）相关要求，采用专属连续出版物的前缀977。

国际图书馆协会联合会（IFLA）是代表图书馆及信息服务及其用户利益的主要国际组织，为全球图书馆及信息行业从业人员发声。
ISSN国际中心是国际图联成员，并参与多个国际图联委员会相关工作。

ISSN国际中心主任担任国际图联期刊与其它连续资源常务委员会秘书，ISSN国际中心项目经理则担任国际图联PRESSoo审议组主席。

ISSN工作人员担任目录部门联络成员，并参与两个标准委员会小组工作：书目记录概念模型审议组、ISBD审议组。他们目前正在参与国际图联标准流程手册修订工作组，以及ISBD显示工作组工作。

Latindex是一项由墨西哥国立自治大学（UNAM）于1997年发起的重要计划，旨在加强伊比利亚美洲科学期刊的可见度与推广度，并提升该地区出版期刊的质量水平。Latindex与ISSN国际中心于2015年9月签署了一项为期三年的协议，以期推动双方工作并交换相关期刊元数据。

创建于1939年的美国国家信息标准组织（NISO）是一家非盈利、非政府的行业协会组织。美国国家标准学会（ANSI）委托美国国家信息标准组织负责识别、开发、保持，并出版自愿性质的且基于共识的信息管理标准。

ISSN国际中心是美国国家信息标准组织拥有投票权的成员： https://www.niso.org/members/issn-international-centre

ISSN国际中心支持美国国家信息标准组织的工作目标，即推动针对信息创建、有效管理及交换相关标准的开发与维护，确保人们对研究及学习所用信息的信任。

ISNI（国际标准化组织编码ISO 27729）是旨在识别创意作品作者及其传播工作参与者的标准化国际号码。ISSN国际中心作为ISNI国际局的成员，通过现有ISNI识别码对 ISSN国际数据库书目纪录予以补充，尤其是在出版发行机构的识别方面。这一做法也在ISSN国家中心层面予以广泛开展，以促进ISSN与ISNI之间的互操作性。

DOAJ与ISSN国际中心于2015年12月签署谅解备忘录，以期互相推动对方工作，促进在开放学术资源库（ROAD）框架下的开放连续出版物相关元数据的交换。该项工作协议的优势在于对拥有可靠评估的开放期刊杂志提供简介。对于出版物而言，编入DOAJ索引也意味着其遵守质量方面的要求。

欧盟出版局作为官方服务方为所有欧盟机构、组织、单位提供出版服务。欧盟出版局多年来通过向ISSN国际中心供资的方式对其予以支持，欧盟机构出版物的ISSN号亦由欧盟出版局分配管理。